lftp
pode estar usando descritores de arquivos diferentes de STDOUT e STDERR. Verifique executando o comando em strace
strace lftp ...
e procure as linhas que começam com "write":
write(3, ...
O número é o descritor ao qual o programa grava. Redirecionar esse descritor também.
... >> /var/log/ftp-getter.log 2>&1 3>&1