Eu suponho que você esteja executando o slapd (Open LDAP). Por que não configurar uma replicação entre o servidor antigo e o novo (por exemplo, com syncrepl) como o EJP está sugerindo?
Fazendo isso dessa maneira, você não precisará "dobrar" seus dados ou copiá-los em outro lugar. Leia mais sobre o syncrepl aqui: link
Leia mais sobre como criar uma replicação entre dois servidores LDAP abertos aqui: link