Você deve aprender seus registros e conhecê-los de cor. Mesmo que você não entenda o significado exato de alguma mensagem em particular. Mas então, quando você de repente vir algo fora de ordem, você saberá que tem alguns problemas. Isto é óbvio para você que se você ouvir que o seu HD começou a fazer alguns sons estranhos que você nunca ouviu, então algo errado está acontecendo, mesmo que você não saiba por que soa, certo? O mesmo com os logs.
As conseqüências de ser hackeado podem ser muito dolorosas. Imagine que seu VPS estará envolvido em um esquema complexo de invasão de uma instituição financeira. Você alugou essa entidade virtual e tem controle total. Assim você é totalmente responsável.
A vida é vida ...