Ao iniciar seu aplicativo ou o aplicativo de meteoro de documentação, faça:
meteoro --port [qualquer coisa menos 3000 ou 3001]
A execução com as configurações padrão terá as portas 3000 e 3001, bem como outra porta mais alta para o mongod. Você não deve ter portas mongod entrando em conflito se você usar valores diferentes para --port ao iniciar o aplicativo meteorológico (incluindo o servidor de documentação, que é apenas outro aplicativo de meteoro).