Se você estiver usando o Cairo-Dock 2.4.0 ou posterior, uma sessão personalizada do GNOME já deve estar adicionada ao seu menu de login. Você deve ser capaz de iniciar esta sessão a partir do menu LightDM e obter o Cairo-Dock sem o Unity, sem necessidade de mais mexericos.
Informações mais detalhadas sobre configuração avançada (se desejar), bem como notas sobre problemas comuns e como contorná-las, podem ser encontradas em esta postagem de glx-dock.org .