Eu ainda não encontrei nenhum método do GnuTool que possa manipular qualquer coisa além de simples backup de arquivos para o Windows. E mesmo aqueles que têm problemas com arquivos bloqueados e abertos, já que seu sistema operacional (baseado em Posix * nix) ainda permite acesso de leitura a todos os arquivos.
Este é um problema, pois a restauração de uma máquina Windows a partir do backup requer mais do que apenas "restaurar todos os arquivos, refazer o ambiente de inicialização, reinicializar".
Pessoalmente, acho rsync muito simples para o Windows, por isso estou automaticamente desconfiado de algo ainda mais simples do que isso. No entanto, se tudo o que você está procurando é o backup de arquivos do Windows, o Rsync definitivamente fará o trabalho (dentro de suas limitações).
Outro método que vi usado com sucesso é inverter a direção do backup. O servidor de backup monta o compartilhamento do Windows que você deseja fazer backup e, em seguida, faz os métodos de backup baseados em arquivo local por meio dele (novamente, o rsync funciona bem para isso).