Depende de onde /srv ou /home está montado. Se /srv estiver montado em um volume / menor, por exemplo, talvez não seja prudente colocá-lo lá. Apenas certifique-se de colocá-lo em um volume com espaço em disco, desempenho e redundância adequados às suas necessidades de servidores SVN.
Eu realmente não sigo muito o FHS. Na maioria dos meus sistemas eu tenho drive OS / system em / em discos espelhados onde todo o /usr, /var, /home, /etc etc. está localizado e então eu normalmente tenho um ou mais RAIDs montados em /data1, /data2 etc.
Então, quando eu coloco repositórios SVN nesses sistemas, geralmente eu os crio em /data1/svn .
E, como sempre, verifique se os volumes estão incluídos em qualquer solução de backup que você implementou.