Sua pergunta não está clara, mas supondo que você queira rotear seu tráfego 1.2.3.4 para um NIC e 4.3.2.1 para outro que não seja necessário atualizar sua tabela de roteamento usando route .
Exemplo:
route add -net 1.2.3.4 netmask 255.0.0.0 dev eth1
route add -net 4.3.2.1 netmask 255.0.0.0 dev eth0