Assim, após dias de investigação, parece que a resposta é 'Não' - a replicação do Mysql não suporta opções de resolução de conflitos de atualização, como estão disponíveis no cluster do Mysql. Eu não consegui encontrar uma única configuração ou opção que apontasse na direção certa.
Infelizmente o Mysql Cluster não era uma opção para mim porque requer 3 servidores (2 funcionários, um administrador) como mínimo e eu estou executando um sistema de 2 servidores.
Eu investiguei a replicação semi-síncrona (MySQL 5.5), mas isso também não teve melhor resolução de conflitos.
No final, tive que voltar e reconceber o aplicativo para minimizar / evitar o risco de conflito.