Definitivamente divida os dois locais em Sites do AD e defina seus cronogramas de replicação de acordo, o que deve ajudar na conectividade e coordenação entre sites. Eu recomendo strongmente usar uma VPN para esse tráfego. Como alternativa, um ponto a ponto usando o IPSec entre os Sites seria minha segunda opção.
Para backup / snapshot, mantenha os tempos de sincronização em mente ao programar suas sincronizações do AD e planeje evitar grandes alterações do AD durante os períodos em que você está realizando os backups entre sites. O material de backup / snapshot será o mais sensível às condições de largura de banda entre os dois sites. Definitivamente use um método bu / snap assíncrono, essas distâncias são f-a-r muito grandes para as síncronas. Somente você pode prever quais serão suas necessidades de transferência durante esse período, então teste e assista às coisas.
A única bandeira vermelha que vejo é que o seu snap / bu pode não ser concluído a tempo de ser útil. Fique de olho neles.