Para mover o nó mestre de um servidor para outro, é necessário copiar a árvore de diretórios /var/lib/munin para o novo servidor. Você pode querer usar rsync para fazer isso.
Experimente a cópia e execute os dois servidores em paralelo por um tempo. Se você não quiser perder o histórico, talvez queira copiar o diretório de arquivos por diretório ou servidor por servidor entre buscas de dados munin. Use scp ou alguma outra cópia incondicional para essas cópias. Procura-se em intervalos de cinco minutos nos cinco anos.
Se a cópia for executada com rapidez suficiente, ou se você não se importar de perder uma amostra, poderá encerrar o novo servidor enquanto executa a cópia final.
Quando estiver satisfeito com o novo servidor, encerre o munin no servidor antigo.