O InnoDB pode ser ativado / desativado em seu my.cnf (configuração MySQL), mas, para usá-lo, o MySQL deve ter sido compilado com suporte a InnoDB.
Quando executo a consulta "Show Engines" neste host Linux específico, ele mostra que o mecanismo de armazenamento InnoDB está desativado. Outros mecanismos de armazenamento (como o MyISAM) estão mostrando ativados.
Quais etapas eu preciso tomar para instalar / ativar o mecanismo de armazenamento InnoDB (mesmo em um nível alto)? Os procedimentos seriam diferentes para diferentes tipos de linux?
O mais provável é que ele não esteja desabilitado no momento da compilação (como normalmente não é), mas não foi iniciado. Verifique o log de erros do mysql. Provavelmente não foi possível gravar os arquivos ibdata necessários.