Você provavelmente tem um caractere perdido ou uma citação incompatível. Há algo no seu arquivo de lote que você não está mostrando. É o espaço antes do "D" na mensagem de erro realmente lá (ou é um erro de digitação em sua pergunta)? Se for real, isso e o fato de que o erro mostra o diretório, mas não o nome do arquivo, fornece pistas sobre a origem do problema.
Tente ver se isso faz alguma diferença:
start "title" D:\folder1\bin\run.bat
Adicionando um título como esse para cada linha.