Sim, essa estrutura é para um usuário.
A estrutura para todo o domínio será, por exemplo:
/home/vuser/your_domain/
user1 user2 user3
Dentro de cada usuário, você tem a estrutura de Maildir
. Normalmente, os servidores de email como courier
são muito flexíveis. Você pode personalizar a estrutura, se quiser. O prefixo /home/vuser
pode ser qualquer caminho.