Você tem o porto certo lá? Existem dois conectores diferentes no XML do servidor JIRA. O HTTP está no 8080 por padrão.
O AJP normalmente é o 8009 por padrão:
<Connector port="8009" maxHttpHeaderSize="8192" maxThreads="150" minSpareThreads="25"
maxSpareThreads="75" useBodyEncodingForURI="true" enableLookups="false"
redirectPort="8443" protocol="AJP/1.3" acceptCount="100" connectionTimeout="20000"
disableUploadTimeout="true" />
EDITAR
Agora você tem a porta certa, parece ser um problema de protocolo. Eu verificaria se o proxy_ajp_module está carregando corretamente:
apache2ctl -t -D DUMP_MODULES
Você pode querer mover todas as suas configurações de proxy para fora da seção <IfModule proxy_http_module>
para testar também.