isso soa como uma má idéia para configurá-lo dessa maneira. Eu teria dado ao servidor 2003 2 NICS e habilitado o roteamento e acesso remoto nele. Clientes em vlan1 poderiam, então, rotear para vlan2 através do servidor onde poderíamos implementar algumas regras básicas de filtragem e firewall.
Você poderia configurar o servidor como um servidor dhcp para ambas as vlans adicionando os escopos apropriados e definindo o agente de retransmissão DHCP na configuração de roteamento e acesso remoto. Desta forma, apenas o servidor requer 2 NICS