Acho que a resposta definitiva terá que ser "chupar e ver" em um servidor de teste - o Wiki da Dovecot tem um seção sobre bloqueio que diz
Because Dovecot uses its own non-standard locking (dovecot-uidlist.lock dotlock file), other MUAs accessing the maildir don't support it. This means that if another MUA is updating messages' flags or expunging messages, Dovecot might temporarily lose some message. After the next sync when it finds it again, an error message may be written to log and the message will receive a new UID.
Se você puder configurar seu cliente para ser somente leitura (ou talvez montar o disco somente para leitura), você deve estar OK.
... ou se você puder arcar com o espaço em disco para a caixa de correio em que está trabalhando, poderá configurar seu cliente para se conectar ao IMAP via host local e evitar totalmente a bagunça.