Não sei como fazer o sshd fazer isso, embora a solução de Kyle seja certamente válida (supondo que você esteja usando chaves e um agente, e aguarde alguns segundos entre o término do upload e a solicitação sync
).
Se você é paranoico com a perda de dados, sugiro investir em um no-break e em um cartão RAID com um backup de bateria.
Se o custo for um problema, você pode montar o sistema de arquivos de destino com a opção sync
(força todas as gravações a ocorrerem de maneira síncrona).
A montagem com sync
set será um sucesso de desempenho, mas quando sua transferência estiver concluída você saberá que os dados estão todos no disco (sujeitos aos caprichos dos caches do controlador de disco, que se você estiver usando um controlador RAID decente pode ser um atraso perceptível - veja acima:).