Soa como um problema de driver ou falha de hardware. Eu começaria atualizando todos os drivers e firmware de hardware relacionados ao armazenamento e ao chipset.
Você também pode entrar em contato com a (s) linha (s) de suporte dos fabricantes e perguntar se eles já viram uma situação como essa. Eu sei como louco como isso soa, na metade do tempo eles têm uma solução rápida (ou pelo menos pode identificar o problema).
Se você tiver uma verificação de programa de gerenciamento para erros ou informações de saúde da unidade. Verifique se há setores remapeados ou outros indicadores de que uma unidade está com problemas.