Dada a quantidade de memória é de cerca de 200MB, eu estou supondo que você não ficou sem memória. Você pode verificar o dmesg para ver se a máquina ficou sem memória.
Se outros processos morrem com um problema semelhante, ou com um erro de bus, então é possível que você tenha memória defeituosa. Você poderia usar o memtest86 para verificar.
Caso contrário, eu diria que você encontrou um bug no mysql. Você pode tentar atualizar para a versão mais recente do MySQL, ou se você está no mais recente, faça downgrade e veja se consegue o mesmo problema. Se você fizer isso, sugiro arquivar um bug no MySQL.