Eu vi falhas semelhantes do VMWare, onde o acesso aos arquivos foi comprometido. Um VMDK corrompido ou instantâneo ou espaço livre insuficiente.
Faça um "CHKDSK X: / R / F / X / V" no sistema de arquivos host (substitua o X: com o ID da unidade correto) e veja se ele conserta coisas (talvez seja necessário reinicializar).
Se isso falhar, tente criar um novo disco virtual e crie uma imagem do disco antigo (de dentro da VM). Em seguida, configure-o para inicializar a partir do novo disco. Se o seu problema foi embora, provavelmente foi um VMDK corrompido.
Claro que se o seu problema for espaço em disco, ignore o anterior e obtenha uma unidade maior.