Não é possível reduzir um sistema de arquivos JFS usando as ferramentas padrão. O Compunix fornece algumas ferramentas que afirmam ser capazes de reduzir os sistemas de arquivos JFS, mas não há uma ampla descrição de sua confiabilidade ou taxas de sucesso.
Geralmente, não é possível alternar os sistemas de arquivos no local, a menos que você esteja alterando versões do mesmo sistema de arquivos (ext2- > ext3- > ext4) ou convertendo FAT em NTFS em determinados sistemas Windows.
Em teoria, se o seu sistema de arquivos JFS não ocupar todo o disco, e você tiver muita sorte de saber onde o FS é colocado no disco, você pode copiar arquivos para outra partição, excluir a partição JFS e Aumente a outra partição e seu sistema de arquivos (certifique-se de escolher algo que possa crescer, como ReiserFS ou XFS).