No SSIS, há uma tarefa do SSIS que pode transferir todos os trabalhos ou apenas trabalhos específicos. Você pode dizer para sobrescrever os trabalhos, ou falhar se eles existirem, e lidar com a exclusão do trabalho. Agende isso como um trabalho para ser executado todas as noites ou torne-o parte de seu processo de liberação de emprego para executar esse trabalho depois que um trabalho for alterado.
Você desejará adicionar uma tarefa SQL depois que as tarefas tiverem sido transferidas para desativá-las usando os procedimentos no banco de dados msdb.