Primeiramente eu tentaria parar o Apache regularmente
root@debian:/etc# sudo /opt/bitnami/ctlscript.sh stop apache
Depois disso, é inteligente ver se o apache foi realmente encerrado
ps aux | grep apache
Se você vir o ID do processo com o apache, tente enviar primeiramente o sinal kill
kill process_id
Novamente, liste os processos com o comando ps e, se vir o apache, mate-o com SIGKILL
kill -9 process_id
Agora você verá o apache ainda em execução - > isso significa que algo está reiniciando e você precisa descobrir por quê. Ou você não verá mais nenhum processo. Se for esse o caso, inicie o apache novamente.
root@debian:/etc# sudo /opt/bitnami/ctlscript.sh start apache
Se você receber um erro novamente, significa que o apache foi iniciado duas vezes. Portanto, provavelmente há algum problema com o script de inicialização /opt/bitnami/ctlscript.sh , mas eu realmente duvido disso.
Uma vez que você identifique se o problema é porque o apache é reiniciado automaticamente quando você o mata ou é iniciado duas vezes, você deve se aprofundar em um problema, mas duvido que a depuração apropriada possa ser feita através de um site de QA como este. e, em vez disso, recomendaria o administrador experiente.