O OpenSCAP (biblioteca OpenSCAP e aplicativo de linha de comando) habilitou recentemente o suporte do Windows em sua ramificação mestre. Ele não está completo, mas está funcionando, como sugere este post no Twitter: link
A versão para Windows ainda não foi lançada. No entanto, é possível criá-lo a partir do código-fonte no Windows usando o Visual Studio 2017. link
Usar a GUI (Workbench) não é possível agora.