O Windows Server 2016 não possui software embutido para limitar o uso da CPU por usuário do RDS.
O Windows System Resource Manager costumava ser obsoleto, já que o Windows Server 2012 R2 acredita e não está mais disponível desde o Windows Server 2016.
Aplicativos de terceiros ainda podem conseguir isso.
No entanto, se você tiver certeza de que nenhum aplicativo desse tipo está instalado e ativado, talvez os aplicativos de cálculo não estejam otimizados para cálculos multithread.
Por exemplo, se sua máquina tiver 8 núcleos. Um único aplicativo encadeado usa até 100% de CPU de um único núcleo. Isso resultaria em um uso total da CPU de 12,5%
Um método usado mais comum para testar a CPU é usando Prime95 . Você pode executar testes com o Prime95? Usando essa ferramenta, você deve atingir o uso de 100% da CPU.