Você precisa configurar os contextos do arquivo SELinux para que eles sejam definidos corretamente quando os arquivos forem criados. Arquivos em geral, herdam o texto fcon de seu diretório pai, então você precisa especificar isso corretamente. Algo como
semanage fcontext -a -t httpd_sys_rw_content_t "/disk2/app/uploads(/.*)?"
restorecon -Rv /disk2/app/uploads
deve ao truque.