-l é para saída, não para o local da configuração.
Você provavelmente queria algo mais parecido com slapcat -n 0 -F /etc/openldap/slapd.d/ -l ~/slapdconfig.ldif .
Neste ponto, você pode ter destruído sua configuração (ou pelo menos a parte cn=config dela. Espero que você tenha um backup. Se não, você poderá extraí-lo do servidor em execução se tiver um dn com acesso apropriado a cn=config . Certifique-se de obter os conjuntos de atributos * e + .