O Nautilus usa o comando net usershare info
para obter informações sobre compartilhamentos Samba definidos pelo usuário não raiz. Veja a página da web para mais informações sobre este comando.
Se esse comando falhar, o Nautilus assume que não há tais compartilhamentos e exibe a mensagem de erro que recebeu caso você queira.
A criação da pasta /var/lib/samba/usershares/
deve impedir que a mensagem apareça:
sudo mkdir -p /var/lib/samba/usershares/