Pode ser que o script Python grave em stdout e stderr, e você esteja redirecionando apenas um deles (para um arquivo ou através de tee
).
Para verificar qual saída vai para onde:
./myscript 2>/dev/null # shows only stdout
./myscript >/dev/null # shows only stderr
Para redirecionar os dois:
./myscript >myfile 2>&1 # both to myfile
./myscript |& tee ... # both through tee