Se você ler a lista de ganchos disponíveis , verá que há um post-merge hook ...
... mas não está claro pela sua pergunta que isso vai fazer o que você quer. Um post-receive hook é executado em um repositório git remoto após receber atualizações de um cliente, enquanto post-merge hooks é executado em seu repositório local após uma operação de mesclagem (incluindo git pull , a menos que você tenha definido o git para rebase em vez de mesclar).