É explicado pelo seguinte: o arquivo /etc/environment não é um script de shell e contém apenas propriedades que são lidas quando o sistema é iniciado. O comando source é usado para iniciar scripts de shell no console atual. Você pode reiniciar o sistema para aplicar as alterações ou adicionar essas linhas aos arquivos ~/.profile ou ~/.bashrc e iniciar o comando source para um deles.
Observe que as propriedades do arquivo /etc/environment serão aplicadas a todos os usuários. as linhas do arquivo ~/.profile apenas para um definido.