Contanto que você tenha as imagens de disco da VM disponíveis e tenha as definições de VM no lugar, elas funcionarão. Certifique-se de ficar com a mesma distribuição, porque a forma como as VMs são definidas em diferentes distros pode variar.
Estou executando o KVM em um servidor Ubunutu 14.05. O servidor possui 2 unidades de 1,2 TB, cada uma com 1 VM (nós de busca elástica). Eu fiz um dd para clonar o sistema operacional principal e pode arrancar a partir de qualquer disco sem problema.
Caso a unidade principal do sistema operacional fique inativa e eu inicie a partir do backup, terei que fazer algo especial para que o sistema operacional de backup leia as VMs? Do meu teste, parecia que não.
Contanto que você tenha as imagens de disco da VM disponíveis e tenha as definições de VM no lugar, elas funcionarão. Certifique-se de ficar com a mesma distribuição, porque a forma como as VMs são definidas em diferentes distros pode variar.