Como você pode ver nos seus registros:
- você está usando o python 2.6, o que eles acham que é desonesto o suficiente para rotulá-lo
very experimental
- você está perdendo o pacote
python-virtualenv
, possivelmente porque não está disponível para sua distribuição
Eu estou supondo que você está no RHEL6 / centos6 e então seus pacotes python 2.7 são nomeados python27*
e o permite-criptografar scripts não são inteligentes o suficiente para descobrir isso ainda.