Na minha opinião, a maior desvantagem de manter apenas um único host RDS é que todos de seus usuários são afetados quando você precisa desativá-los para manutenção / correção, além de qualquer tempo de inatividade inesperado.
A divisão da carga entre vários servidores permite "drenar" interromper o serviço em um servidor que você precisa fazer manutenção, eliminando efetivamente o tempo de inatividade do usuário para toda a manutenção planejada (que também permite fazer manutenção durante o horário comercial). E, no caso de um tempo de inatividade inesperado, somente a parte dos usuários que usam o servidor inativo seria afetada; e apenas o tempo suficiente para se reconectar a outro servidor no farm.