Pelo que entendi, atualmente você acabou de copiar as pastas pessoais dos usuários no HDD e recriou seus perfis no Open Directory, com as pastas base corretas. Este é o primeiro passo para fazer logins de rede. Em seguida, você precisa vincular todas as máquinas clientes ao Open Directory através das Preferências do Sistema de cada máquina cliente manualmente.
Vá para Preferências do Sistema - > Usuários e Grupos - > Bloqueio no canto inferior direito (senha) - > Opções de login - > Servidor de conta de rede (junção).
Em seguida, insira o endereço do OD Server, siga as instruções na tela, configure a ligação do OD e termine. Agora, saia e vá para a tela de login do usuário. Você deve ver um novo usuário "bolha" para outras contas. Digite o login do usuário do cliente (como encontrado no OD) e a senha e ele deve efetuar login com a pasta inicial da rede. Todas as alterações feitas nessa conta só seriam encontradas na pasta base da rede, não na local.
Depois de verificar se tudo está funcionando corretamente, você está livre para excluir a pasta base local da máquina cliente, para que ela possa fazer o login pela rede.