O caminho padrão para os arquivos de banco de dados MySQL no Ubuntu é / var / lib / mysql / . Se ele foi modificado (ou instalado diferente do pacote oficial do Ubuntu), verifique datadir em /etc/mysql/my.cnf ou o script de inicialização do serviço.
Quando você reinstalar o sistema operacional com o MySQL, basta substituir o novo diretório de dados pelo antigo (com o serviço mysql interrompido, é claro). Lembre-se sobre as permissões corretas - definir mysql : mysql e 0700 ou similar seguro. Você pode usar o tar para arquivar o antigo, para que ele cuide de todas as permissões.