O substituto direto para o MySQL-5.6 é o MariaDB-10.0.x, não o release 5.5. E mesmo assim não tenho certeza se todos os recursos do Mysql já foram portados para o MariaDB.
No momento, a versão atual de databases/mariadb100-server
é 10.0.17. Você pode substituir as portas desta maneira:
pkg delete -f mysql56-server
pkg delete -f mysql56-client
make -C /usr/ports/databases/mariadb100-server install clean
Espero que você experimente tudo isso na máquina de teste primeiro.