O texto que você encontrou está correto, o SMB requer autenticação ntlm que não é compatível com o PAM.
O problema com o PAM é que o usuário (ou um agente agindo em nome dos usuários, como seria o servidor samba) deve enviar a senha em texto puro do usuário, que o servidor Samba nunca conhece, porque o cliente SMB nunca envia .
O cliente SMB, em vez disso, envia o hash MD4 do unicode little endian de 16 bits da senha do usuário, com um desafio do servidor Samba.
No mundo real, o Samba geralmente se autentica no AD, e o RADIUS também se autentica no AD (via winbindd), e é assim que você obtém credenciais sincronizadas.
O Samba também autentica contra o LDAP simples, portanto, você pode, alternativamente, usá-lo como seu armazenamento de credenciais comum.