Não, não - não está correto. Se você tiver um servidor, RDP / TS ou Citrix XenApp (ICA) com sessões de usuário ativas nele e desativar esse servidor, ele eliminará as sessões desses usuários e tudo o que eles não salvaram será perdido (dependendo do aplicativo .)
Se eles tentarem se reconectar ao farm e ainda houver servidores que publicam os aplicativos aos quais eles estão se conectando, eles receberão uma nova sessão em um servidor diferente.
A maneira típica de fazer isso é, com muita antecedência, desativar "novas sessões" no servidor e aguardar o atrito normal (que será "normal" apenas para os aplicativos e usuários do local de trabalho) para reduzir o número de usuários para 0 nesse servidor. Então, ninguém será afetado quando você pula.
Para o XenApp 6.5, isso está no AppCenter. Encontre o Servidor em questão, clique com o botão direito em Outras Tarefas e escolha a opção Proibir Login que melhor atenda às suas necessidades. 
A outra maneira, que pode ser combinada com essa maneira, é ter janelas de manutenção publicadas / comunicadas reais durante as quais os usuários saberão que não devem usar os servidores Citrix. Quaisquer conexões restantes durante essa janela podem ser eliminadas ou, dependendo do local de trabalho e dos usuários, você pode contatá-las e fazer com que elas façam logoff sem problemas.