O MD1000 é um gabinete "JBOD". O dispositivo ao qual ele se conecta recebe acesso a todos os discos rígidos. Se o dispositivo for um controlador PERC 5 / e, a placa pode gerenciar as unidades para você em conjuntos RAID e apresentar Discos Virtuais ao sistema operacional.
No entanto, com uma placa SAS 5 / e, você acabaria vendo cada disco rígido separadamente no sistema operacional (se ele funcionasse - como você disse, na verdade é uma configuração não suportada).
Se você quiser que uma configuração validada funcione corretamente, vá para a placa PERC 5 / e.
As placas MD1200 + SAS 6 / E são suportadas agora com o Server 2012 e Storage Spaces para gerenciar as unidades ... Eu estaria curioso para saber se você poderia fazer isso funcionar no hardware que você tem agora, como o PE2950 suporta o Server 2012 (não-R2). Pode valer a pena tentar!