Coisa totalmente básica! O login em ssh só executa o .bash_profile e não o .bashrc . Todos os diretórios do meu PATH para Anaconda e Jupyter foram adicionados ao .bashrc. Eu segui este conselho e adicionei o seguinte ao meu .bash_profile
if [ -f ~/.bashrc ]; then
source ~/.bashrc
fi
Agora vamos para a próxima coisa básica que eu estraguei!