A principal questão é com os espaços de trabalho (múltiplos desktops), que no Unity são implementados de forma bastante diferente daqueles no Openbox / GNOME: Unity usa um enorme desktop dividido em vários menores, e se uma janela pertence a um desktop depende suas coordenadas. O Openbox e o GNOME mostram os desktops como se estivessem empilhados uns sobre os outros, com apenas um visível; se uma janela pertence a uma área de trabalho depende de uma tag.
Tenha também em mente que, nos bastidores, o Unity usa o Compiz como gerenciador de janelas, não o gerenciador de janelas do GNOME.
Assim, você pode usar no Unity qualquer painel que seja capaz de interagir adequadamente com o Compiz. Tint2 pode fazer isso. Eu não sei sobre os outros.
Se você não usa vários desktops, a maioria dos painéis pode funcionar bem para você.
Sobre o uso do painel Unity no Openbox, eu não sei.