Não há pacote libc6 no Red Hat Enterprise Linux. O nome do pacote para os mesmos arquivos é glibc . Parece que alguém instalou um pacote em seu servidor a partir de uma distribuição Linux diferente e cancelou os erros que teria recebido ao tentar fazer isso (que são praticamente os mesmos que você viu aqui).
Isso, é claro, coloca seu banco de dados RPM em um estado inconsistente em relação ao software real instalado e pode causar problemas de compatibilidade e dependência, como os que você encontrou hoje. Não é mais possível atualizar os pacotes dos repositórios suportados, por exemplo, e é difícil determinar exatamente qual código está sendo executado no sistema.
Meu melhor palpite é que alguém (que realmente não sabe o caminho certo para fazer isso) tentou atualizar o glibc além da versão fornecida pela Red Hat, muito provavelmente para tirar proveito de um novo recurso que não está presente em a versão do glibc enviada com o EL6.
O caminho certo, se você realmente precisa desta versão tardia do glibc, é pegar o RPM de origem da Red Hat, ajustar o arquivo de especificação e quaisquer correções para construir a nova versão da glibc e usar os novos RPMs binários da nova versão . Você, então, é responsável por mantê-lo por conta própria, pode perder o suporte do fornecedor, etc., portanto, isso é algo que você deve pensar se os requisitos de negócios exigirem isso. (E como você perde seu apoio de qualquer maneira, você pode também mudar para o CentOS ...)