Com base na sua pergunta, estou supondo que uma das duas coisas está acontecendo:
- Você está vendo o banner do servidor padrão do Apache com o nome do host incluído. Você precisa atualizar o nome do host do sistema ou especificar algo no httpd.conf. Isso não é específico para a AWS.
- Se não for 1, provavelmente você está se referindo ao DNS reverso da solução IP do seu servidor para um nome de host da AWS. Se você precisar de DNS reverso válido com seu domínio personalizado, precisará de um Elastic IP, conforme observado aqui: link
Em qualquer caso, precisamos saber o que você quer dizer com "as respostas da Web do servidor usando o domínio AmazonAws.com" para responder à sua pergunta.