1) Não deve haver problemas usando o rsync, você também pode usar dirvish , que é uma solução melhor caso você queira que backups incrementais sejam feitos. feito.
2) O rsync deve ser o suficiente, mas, como antes, use melhor dirvish, pois ele dará um melhor controle caso você precise de backups incrementais.
3) Não deve haver problemas aqui, o rsync e o dirvish podem usar o sftp para transferir dados, portanto a transferência deve ser bastante segura.