Isso não está muito relacionado ao apt-get e provavelmente deveria ter terminado sem problemas. Você precisa atualizar sua configuração do mdadm.
Tente isto:
mdadm --detail --scan >> /etc/mdadm/mdadm.conf
Em seguida, edite /etc/mdadm/mdadm.conf para remover as entradas duplicadas e limpe-as.
Você pode então verificar se funcionou reinstalando o kernel do linux (ou você poderia fazer o update-initramfs):
apt-get --reinstall install linux-image-3.2.0-23-generic
A propósito, isso só será realmente um problema se o raid com UUID c9807851: b5d3a910: 3fb6082e: e5593158 for necessário em algum lugar no processo de inicialização. Caso contrário, seu sistema ainda inicializará bem. Embora você possa ter que entrar no console de recuperação, diga se o / home está localizado no ataque e ele falha ao montar durante a inicialização, você será direcionado para um login de recuperação onde você pode iniciar o ataque manualmente.