A resposta é especificar a fonte múltipla no registro de configuração do LDAP.
Observe o espaço que separa as especificações do host no AuthLDAPURL, bem como o fato de que a diretiva está entre aspas:
Seção do http.conf em questão:
<AuthnProviderAlias ldap ldap1>
AuthBasicProvider ldap
AuthLDAPURL "ldap://ldap1.server.com:389 ldap2.server.com:389 ldap3.server.com:389/dc=server,dc=com?sAMAccountName?sub?(objectClass=*)"
AuthLDAPBindDN "CN=matcher,OU=Application Accounts,dc=server,dc=com"
AuthLDAPBindPassword "SECRET"
</AuthnProviderAlias>
<AuthnProviderAlias file file1>
AuthUserFile /etc/mdpctest/htpasswd.users
</AuthnProviderAlias>
<Directory /srv/www/htdocs/mdptest>
Order deny,allow
Deny from All
AuthName "Request Access"
AuthType Basic
AuthBasicProvider file1 ldap1
AuthzLDAPAuthoritative on
require valid-user
Satisfy any
</Directory>