Critérios de seleção e criação de perfil do processador do servidor

Question

Estamos comprando um servidor para executar vários pacotes de software de Bioinformática. O pacote principal em nossa máquina de teste é multi-threaded e é totalmente ligado à CPU, o IO & A RAM não está limitando o desempenho - a CPU funciona a 100%, enquanto a RAM & O disco IO está em níveis mínimos.

Queremos garantir que tenhamos o melhor processador (s) para nossa carga de trabalho, mas, dada a grande lista de opções do Intel Xeon, como podemos selecionar o melhor para as nossas necessidades?

Eu aprecio que em um nível fundamental, "mais"="melhor", mas como posso saber se, por exemplo, uma velocidade de barramento mais rápida faz uma grande diferença em comparação a um grande cache ou se mais núcleos são melhores que a velocidade do clock.

Existe uma maneira de criar um perfil do nosso pacote de software para descobrir qual processador escolher. O software em questão é uma coleção de scripts Python, para que possamos fazer o perfil no Linux ou no Windows.

    

Answer 1

Você deu uma olhada no cachegrind , que é parte do realmente excelente Valgrind pacote de perfis de memória?

Cachegrind, pelo menos, dá uma idéia de quanto de cache está ocorrendo. Você pode achar que seu aplicativo trava o cache tanto que não importa se você tem o cache L2 / L3 maior de um Xeon ou não, então, novamente, você pode estar preso ao pipeline da CPU e a thrashing pode não estar ocorrendo muito.

Cachegrind também permite que você defina tamanhos de cache arbitrários, assim você poderá testar seu código em vários cenários de tamanho de cache.