Tenho certeza que seu problema está acontecendo antes que o código do aplicativo tenha a chance de ser executado - o erro parece vir do CLR (Common Language Runtime), que é responsável pelo carregamento adequado do aplicativo e de quaisquer dependências.
Eu definitivamente tive esse tipo de erro em algum momento no passado, mas não me lembro da causa exata. As discussões nesta postagem podem lhe dar algumas ideias:
Além disso, se você usar FILEMON.EXE para registrar a atividade enquanto o programa está sendo iniciado, é muito provável que você veja um erro em um arquivo que não pode ser acessado ou localizado. Pode ser um monte de linhas de log para cavar, mas se você carregar o arquivo de log no Excel, é muito fácil classificar os dados e encontrar algumas pistas.
Espero que algo aqui ajude ...